Лаборатория за изпитване „Дунавлаб“ разполага с изградена микробиологична лаборатория, която включва подготвително помещение, ламинарен бокс, кухня среди, помещение за изолиране на патогени, помещение за инкубация и отчитане, миячно и помещение за автоклавиране и отпадъци. В сектор Микробиология се прилагат стандартизирани международни методи за изпитване на различни групи хранителни продукти с цел доказване на хигиена и безопасност на храни, контактни повърхности, води и др.